Die Captain Morgan Rum Company wurde 1944 vom Seagram Präsidenten Samuel Bronfman gegründet. Der Firmen-Name nimmt Bezug auf Henry Morgan, einem bekannten walisischem Freibeuter aus dem 17. Jahrhundert, der besonders in karibischem Gewässer auf Raubzüge ging.
Samuel Bronfman erwarb für die Produktion des Rums die Long Pond Destillerie aus dem Besitz der Regierung Jamaikas. Zusätzlich kaufte der Seagram Präsident von den ansässigen Levi-Brüdern – zwei Apothekern – ein Familienrezept für aromatisierten Rum ab, um dieses für den Captain Morgan Rum anzuwenden.
Im Jahr 1950 verkaufte das Seagram Unternehmen die Destillerie an die Serralles Group, 2001 folgte der Verkauf der Marke Captain Morgan an den Spirituosen-Konzern Diageo.
Mit etwa 54 Millionen Litern gehörte Captain Morgan im Jahre 2004 zu den meistverkauften Rum-Sorten der Welt.
Die Produktpalette Captain Morgans umfasst in den USA insgesamt acht verschiedene Sorten, unter anderem den Original Spiced Gold, den Silver Spiced Gold, den Private Stock und den 100 Proof Spiced Gold. In Deutschland ist hauptsächlich der Original Spiced Gold vertreten. Offiziell ist noch der Black Label eingeführt worden, der sich aber noch nicht etablieren konnte. In wenigen Online-Shops sind zudem der Private Stock und der Kokos-Likör Parrot Bay zu haben. Eine Auflistung der getesteten Produkte von Captain Morgan befindet sich auf der Captain-Morgan-Übersichtsseite.